Действующий
31. Управление экономики и прогнозирования речного транспорта
32. Управление персонала и учебных заведений речного транспорта
Служба автомобильного и городского пассажирского транспорта:
33. Департамент автомобильного транспорта
34. Управление городского электрического транспорта и метрополитена
35. Управление промышленного транспорта
36. Департамент координации транспортных систем и логистики
37. Департамент инвестиционной политики и программ развития
38. Департамент государственного имущества на транспорте
39. Департамент экономики
41. Департамент бухгалтерского учета, отчетности и методологии
43. Департамент социального развития и кадров
44. Департамент международного сотрудничества
45. Департамент российской транспортной инспекции
46. Управление региональной транспортной политики
47. Научно-техническое управление
48. Управление безопасности на транспорте
49. Управление по мобилизационной подготовке и чрезвычайным ситуациям
50. Управление делопроизводства
51. Административно-хозяйственное управление
52. Контрольно-ревизионный отдел
53. Отдел помощников Министра и пресс-службы
